Самый обширный подкласс современных пресмыкающихся составляют ящерицы, хамелеоны и змеи, получившие все вместе название чешуйчатых пресмыкающихся (Squamata), так как их тело покрыто роговыми чешуями. Величина и форма этих чешуй могут быть весьма различны; на голове и на брюшной стороне тела вместо чешуй часто имеются плоские или килеватые щитки, такие очень различной величины и формы. В отличие от крокодилов и большинства черепах чешуйчатые пресмыкающиеся не имеют цельного костного нёба, так как крыловидные кости у них или расходятся сзади или совершенно разделены продольной щелью; такая же щель имеется часто и между нёбными костями, и потому внутренние носовые отверстия открываются в ротовую полость очень близко к ее переднему краю. Височные дуги или обе отсутствуют, или сохраняется только одна верхняя дуга. Квадратная кость соединена с черепом подвижно. Зубы срастаются с краем челюсти и никогда не сидят в ячейках. Язык может в большей или меньшей степени высовываться изо рта. Отверстие клоаки в виде поперечной щели. Самцы обладают парным органом совокупления. Размножение происходит или путем откладывания яиц, покрытых, как правило, пергаментообразной оболочкой, или детеныши родятся живыми.
Среди современных рептилий чешуйчатые представляют собой единственную группу, находящуюся в полном расцвете в настоящее геологическое время. Этот подкласс разделяется на 3 отряда: ящерицы, хамелеоны и змеи.